Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Rnf138rt1Q9D9M9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Rnf138rt1Q9D9M9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Rnf138rt1Q9D9M9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Rnf138rt1Q9D9M9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Rnf138rt1Q9D9M9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Rnf138rt1Q9D9M9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf138rt1Q9D9M9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf138rt1Q9D9M9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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