Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp4cQ9D7F7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp4cQ9D7F7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms