Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Rpap3Q9D706 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpap3Q9D706 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms