Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr42e1Q9D665 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr42e1Q9D665 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr42e1Q9D665 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms