Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zcchc13Q9D548 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Zcchc13Q9D548 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Zcchc13Q9D548 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Zcchc13Q9D548 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Zcchc13Q9D548 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Zcchc13Q9D548 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Zcchc13Q9D548 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Zcchc13Q9D548 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Zcchc13Q9D548 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zcchc13Q9D548 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zcchc13Q9D548 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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