Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc83Q9D4V3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc83Q9D4V3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms