Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4931428L18RikQ9D4S9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms