Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700034E13RikQ9D2T6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700034E13RikQ9D2T6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms