Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc47Q9D024 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc47Q9D024 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc47Q9D024 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc47Q9D024 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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