Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrps28Q9CY16 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrps28Q9CY16 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrps28Q9CY16 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms