Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CXL3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9CXL3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CXL3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CXL3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9CXL3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms