Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PsenenQ9CQR7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PsenenQ9CQR7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PsenenQ9CQR7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms