Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sar1bQ9CQC9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sar1bQ9CQC9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms