Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bcl11bQ99PV8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bcl11bQ99PV8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bcl11bQ99PV8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms