Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcg3Q99P81 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcg3Q99P81 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms