Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pbx4Q99NE9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pbx4Q99NE9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx4Q99NE9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms