Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cadm3Q99N28 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cadm3Q99N28 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms