Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms