Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4dQ99N05 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ms4a4dQ99N05 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ms4a4dQ99N05 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms