Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc12a9Q99MR3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc12a9Q99MR3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc12a9Q99MR3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms