Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cmtm3Q99LJ5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms