Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q99KU6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q99KU6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q99KU6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q99KU6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q99KU6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q99KU6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q99KU6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q99KU6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q99KU6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q99KU6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q99KU6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q99KU6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q99KU6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q99KU6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q99KU6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q99KU6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q99KU6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q99KU6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q99KU6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q99KU6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q99KU6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q99KU6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q99KU6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q99KU6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q99KU6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q99KU6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q99KU6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q99KU6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q99KU6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q99KU6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q99KU6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q99KU6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q99KU6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q99KU6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q99KU6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q99KU6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q99KU6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q99KU6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q99KU6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q99KU6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q99KU6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q99KU6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q99KU6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q99KU6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q99KU6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q99KU6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q99KU6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q99KU6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q99KU6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q99KU6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q99KU6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q99KU6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q99KU6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q99KU6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q99KU6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q99KU6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q99KU6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q99KU6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99KU6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99KU6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99KU6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99KU6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99KU6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99KU6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99KU6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99KU6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99KU6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99KU6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99KU6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99KU6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99KU6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99KU6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99KU6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99KU6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99KU6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99KU6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99KU6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99KU6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99KU6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99KU6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99KU6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99KU6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99KU6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99KU6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99KU6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q99KU6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q99KU6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q99KU6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q99KU6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q99KU6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99KU6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99KU6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99KU6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99KU6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99KU6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99KU6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99KU6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99KU6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99KU6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms