Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EpcamQ99JW5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EpcamQ99JW5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms