Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt79Q8VED5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt79Q8VED5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt79Q8VED5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms