Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med17Q8VCD5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Med17Q8VCD5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms