Protein–RNA interactions for Protein: Q8K327

Champ1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Champ1Q8K327 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Champ1Q8K327 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Champ1Q8K327 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Champ1Q8K327 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms