Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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Hpf1Q8CFE2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hpf1Q8CFE2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Hpf1Q8CFE2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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