Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rsph6aQ8CDR2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rsph6aQ8CDR2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rsph6aQ8CDR2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms