Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ4

Amer2, APC membrane recruitment protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer2Q8CCJ4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Amer2Q8CCJ4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Amer2Q8CCJ4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amer2Q8CCJ4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amer2Q8CCJ4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms