Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A430089I19RikQ8C9W1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A430089I19RikQ8C9W1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms