Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhe23Q8BGW3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms