Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Best2Q8BGM5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Best2Q8BGM5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms