Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnpo1Q8BFY9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnpo1Q8BFY9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnpo1Q8BFY9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms