Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4cQ811C2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms