Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lca5Q80ST9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lca5Q80ST9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lca5Q80ST9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms