Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zc3h4Q6ZPZ3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h4Q6ZPZ3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms