Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LcorQ6ZPI3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LcorQ6ZPI3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LcorQ6ZPI3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms