Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppp4r3aQ6P2K6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp4r3aQ6P2K6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppp4r3aQ6P2K6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms