Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Slx4Q6P1D7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Slx4Q6P1D7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Slx4Q6P1D7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms