Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp11bQ6DFW5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11bQ6DFW5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11bQ6DFW5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms