Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TrhQ62361 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TrhQ62361 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TrhQ62361 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrhQ62361 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrhQ62361 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrhQ62361 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrhQ62361 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TrhQ62361 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TrhQ62361 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrhQ62361 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrhQ62361 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TrhQ62361 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TrhQ62361 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrhQ62361 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrhQ62361 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrhQ62361 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrhQ62361 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrhQ62361 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrhQ62361 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms