Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SypQ62277 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SypQ62277 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SypQ62277 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SypQ62277 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SypQ62277 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SypQ62277 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SypQ62277 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SypQ62277 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SypQ62277 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SypQ62277 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SypQ62277 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SypQ62277 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SypQ62277 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SypQ62277 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SypQ62277 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SypQ62277 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SypQ62277 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SypQ62277 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SypQ62277 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SypQ62277 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SypQ62277 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SypQ62277 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SypQ62277 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SypQ62277 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SypQ62277 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SypQ62277 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SypQ62277 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SypQ62277 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SypQ62277 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SypQ62277 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SypQ62277 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SypQ62277 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SypQ62277 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SypQ62277 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SypQ62277 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SypQ62277 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SypQ62277 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SypQ62277 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SypQ62277 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SypQ62277 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SypQ62277 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SypQ62277 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SypQ62277 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SypQ62277 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SypQ62277 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SypQ62277 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SypQ62277 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SypQ62277 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SypQ62277 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SypQ62277 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SypQ62277 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SypQ62277 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SypQ62277 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SypQ62277 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SypQ62277 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SypQ62277 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SypQ62277 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SypQ62277 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SypQ62277 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SypQ62277 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SypQ62277 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SypQ62277 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SypQ62277 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SypQ62277 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SypQ62277 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SypQ62277 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SypQ62277 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SypQ62277 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SypQ62277 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SypQ62277 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SypQ62277 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SypQ62277 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SypQ62277 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SypQ62277 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SypQ62277 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SypQ62277 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SypQ62277 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SypQ62277 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SypQ62277 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SypQ62277 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SypQ62277 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SypQ62277 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms