Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt33bQ61897 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt33bQ61897 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms