Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gli3Q61602 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Gli3Q61602 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gli3Q61602 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms