Protein–RNA interactions for Protein: Q61316

Hspa4, Heat shock 70 kDa protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa4Q61316 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hspa4Q61316 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspa4Q61316 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms