Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf235Q61116 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf235Q61116 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf235Q61116 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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