Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp4Q60972 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms