Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vdac1Q60932 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac1Q60932 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms