Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfrsf8Q60846 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf8Q60846 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms