Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppp1r1bQ60829 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp1r1bQ60829 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms